Institució:
Disseny i desenvolupament de nous algoritmes d’alineament per parelles i acceleradors de maquinari que redueixen el temps d’execució i el consum de memòria.
Mètodes escalables i acceleradors per a l’alineament de seqüències
Disseny i desenvolupament de nous algoritmes d’alineament per parelles i acceleradors de maquinari que redueixen el temps d’execució i el consum de memòria.
Grup d´investigació:
High Performance Computing Applications for Science and Engineering (HPCA4SE)
Investigador/s:
Juan Carlos Moure, Santiago Marco, Antonio Espinosa
Descripció:
Problema:
Els avenços recents en genòmica i en tecnologies de seqüenciació exigeixen algoritmes més ràpids i escalables que puguin gestionar la longitud creixent de les seqüències. Els algoritmes clàssics d’alineament per parelles, basats en programació dinàmica, estan fortament limitats per requeriments quadràtics en temps i memòria. A mesura que milloren les tecnologies de seqüenciació i disminueix el cost de l’assemblatge de seqüències d’alta qualitat, s’espera que la importància dels algoritmes d’alineament per parelles continuï augmentant.
Solució:
Algoritmes d’alineament escalables d’alt rendiment i acceleradors de maquinari.
Àrees d'aplicació:
Ciències de la vida, acceleradors de maquinari, RISC-V
Mercat objectiu:
Aplicacions en ciències de la vida
Keywords:
biologia, ciències de la vida, alineament de seqüències, acceleradors de maquinari
TRL: N/A
CRL: N/A
BRL: N/A
IPRL: N/A
TmRL: N/A
FRL: N/A
Més informació
Si vols saber més sobre aquest projecte no dubtis en contactar amb nosaltres