Métodos escalables y aceleradores para el alineamiento de secuencias

Diseño y desarrollo de nuevos algoritmos de alineamiento por pares y aceleradores de hardware que reducen el tiempo de ejecución y el consumo de memoria.

Los avances recientes en genómica y en tecnologías de secuenciación exigen algoritmos más rápidos y escalables capaces de manejar la creciente longitud de las secuencias. Los algoritmos clásicos de alineamiento por pares, basados en programación dinámica, están fuertemente limitados por requisitos cuadráticos en tiempo y memoria. A medida que mejoran las tecnologías de secuenciación y disminuye el coste del ensamblaje de secuencias de alta calidad, se prevé que la importancia de los algoritmos de alineamiento por pares seguirá creciendo.

Algoritmos de alineamiento escalables de alto rendimiento y aceleradores de hardware.

Ciencias de la vida, aceleradores de hardware, RISC-V

Aplicaciones en ciencias de la vida