Institució:
Les agències de salut pública depenen cada cop més de models epidemiològics computacionals per donar suport a la preparació i la resposta a brots de malalties infeccioses. Tanmateix, el calibratge de simulacions a gran escala basades en dades i l'exploració d'estratègies d'intervenció continuen sent tasques computacionalment exigents que superen les capacitats de les infraestructures informàtiques convencionals. EpiSim-EMEWS combina el simulador epidemiològic EpiSim.jl amb el marc de treball de flux de treball a escala extrema EMEWS per automatitzar l'exploració de models a gran escala en sistemes de computació d'alt rendiment (HPC). La plataforma permet que milers de simulacions s'executin en paral·lel per a la calibració de paràmetres, la quantificació de la incertesa, l'anàlisi de sensibilitat i l'optimització de les estratègies d'intervenció. La seva arquitectura modular admet fluxos de treball personalitzables, múltiples algoritmes d'optimització (per exemple, CMA-ES i algoritmes genètics), anàlisis visuals interactives i desplegament a través d'infraestructures HPC modernes. La tecnologia accelera la presa de decisions basada en l'evidència alhora que permet el desenvolupament de bessons digitals a escala de ciutat per a la planificació de la salut pública.
