Simulación basada en estructura de las propiedades de transferencia de energía resonante de Förster (FRET) a partir de trayectorias de dinámica molecular (MD) combinadas con modelos QM/MM polarizables para estados excitados, y posterior validación de los conjuntos conformacinales de MD mediante la comparación de eficiencias FRET experimentales y simulada
Caracterización FRET de conjuntos de proteínas y unión proteína-ligando
Evaluación de sitios/modos de unión proteína-ligando y preferencias conformacionales de proteínas a través de experimentos FRET y simulaciones multiescala
Grupo de investigación:
Computational Photobiology Lab (CPL)
Investigador/es:
Carles Curutchet
Özge Ergün
Descripción:
Tipo de activo:
Categoría:
Problema:
Validar modelos estructurales atomísticos de unión proteína-ligando y conjuntos conformacionales de proteínas
Solución:
Validar modelos estructurales mediante experimentos y simulaciones FRET
Áreas de aplicación:
Diseño de fármacos basado en la estructura
Novedad:
Validación de conjuntos conformacionales de MD con experimentos FRET basados en la comparación directa de propiedades espectroscópicas, no en la comparación de distancias dador-aceptor derivadas experimentalmente con la aproximación de Förster
Protección:
N/A
Mercado objetivo:
Empresas farmacéuticas y biotecnológicas
TRL: 2
CRL: 2
BRL: 1
IPRL: 1
TmRL: 2
FRL: 3
Impacted SDGs:
N/A
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